흔히 간과되는 게 생산부터 폐차에 이르는 풀 라이프 사이클 친환경 지수이다. 하이브리드와 전기차는 여기에서 진정한 친환경이냐는 의문이 종종 제기되기도 한다. 최근 토요타가 발표한 2009 NAER(North America Environmental Report)에 따르면 프리우스의 친환경 지수는 업계 평균 정도이다.

오토모티브 뉴스에 따르면 프리우스는 빼어난 연비를 자랑하지만 소재의 생산에 관한 5가지 카테고리에서 평균 이하를 기록했다. 프리우스는 일반 자동차에는 없는 니켈-메탈 배터리와 인버터, 전기 모터가 있기 때문에 크게 놀랄 일은 아니라는 게 중론이다. 이 부품들은 제조 과정에서 탄화수소와 PM의 배출을 증가시킨다.